El CIIDIR Unidad Sinaloa, tiene un grupo sólido de investigadores, de los cuales 45 son miembros del SNII, lo que pone de manifiesto su experiencia en investigación.
Actualmente, todos los investigadores se encuentran dirigiendo proyectos relacionados con las líneas de investigación del programa y están comprometidos con la docencia siendo titulares o apoyando en las diferentes asignaturas que brinda el programa de Maestría en Recursos Naturales y Medio Ambiente, los Doctorados en Ciencias en Biotecnología y en Conservación del Patrimonio Paisajístico que se encuentran dentro del Padrón del SECIHTI (CONAHCyT).
Las líneas de investigación están relacionadas con los requerimientos de los sectores productivo y social, contribuyendo al desarrollo integral y sostenible de los recursos de la región.
El CIIDIR-SINALOA está conformado por tres Departamentos Académicos: Acuacultura, Biotecnología Agrícola y Medio Ambiente, estos para asegurar la congruencia de los objetivos del Centro, debido a ello se han establecido tres líneas de investigación principales: Acuacultura, Biotecnología agrícola y Medio Ambiente.
En los últimos años se han ejecutado proyectos de investigación estratégicos con recursos del gobierno del estado de Sinaloa (Fundación Produce Sinaloa, Ayuntamientos, FOMIX y CECyT), así como con dependencias del gobierno federal (CONABIO, SEMARNAT, SAGARPA y SECIHTI) e internacional (EcoHealth Alliance y USDA-APHIS). Estos proyectos han tenido una aplicación directa como respuesta a las demandas de los sectores social y privado.